En s’appuyant sur la récente Loi sur les espèces en péril, et dans un contexte de gestion intégrée de la zone côtière et de conservation de la biodiversité, le Comité ZIP entreprend des actions qui visent le rétablissement des espèces en péril qui fréquentent son territoire.
Dans cette optique, un programme de financement, le Fond sur les espèces en péril, a été créé en 2002 par le Comité ZIP de la rive nord de l'estuaire. La mission de ce projet est de favoriser la protection de ces espèces fréquentant la rive nord de l'estuaire maritime du Saint-Laurent en protégeant, réhabilitant et conservant les milieux marins du territoire. Le fond sur les espèces en péril permet au Comité ZIP de financer, en totalité ou en partie, des projets visant à protéger et rétablir les espèces en péril de la Côte-Nord.